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关于羊肚菌采收，过早采收产量低，过迟采收营养成分低，价值也低。羊肚菌子囊果的成熟以菌柄淡黄色，菌柄初变褐为标志，通常采收的子囊果要以八分成熟为宜，此时整个菇体分化完整，颜色由深灰变浅灰或褐黄，菌盖饱满，盖面沟纹明显，边缘较厚，外形美观，口感最好。羊肚菌通常上午9-12时采收，必须一朵一朵地采，而且不能沾到泥土。采收时用左手3个指头轻轻握住菌柄，右手用竹片等非金属物轻轻撬起子囊果。注意不能用手拔，因为最下面的部分留在泥里，土里遍布着菌丝，像一张供应养分的网，有些好的还能生长起来，一茬接一茬，可以一直采收到4月份，但是如果铲断了菌丝，就不会再继续出菇了。